Управление деятельностью Образовательной организации осуществляет Общее собрание учредителей (высший орган управления)
Правление, Педагогический совет, Конференция работников, Экспертный совет, Попечительский совет – постоянно действующие коллегиальные органы управления ОАНО «Сверхновая школа»
Директор ОАНО «Сверхновая школа» - единоличный исполнительный орган
Структурные подразделения ОАНО «Сверхновая школа»